一般情況下，提交查重時，參考文獻這部分內容是附帶一起提交的，但是大部分查重系統特別是學術查重系統是可以有效識別出參考文獻的，識別出來的參考文獻里面的內容是不會被標紅的。正常識別出參考文獻的情況下，參考文獻是不會有重復的。如果由于格式錯誤等原因導致參考文獻當做正文被標紅了，那此時就有相似比或重復率了。

被認定為抄襲的本科畢業設計(論文)，包括與他人已有論文、著作重復總字數比例在30%至50%(含50%)之間的，需經本人修改。修改后經過再次檢測合格后，方可參加學院答辯。再次檢測后仍不合格的，按結業處理。須在3個月后提交改寫完成的畢業設計(論文)，檢測合格后再參加答辯。這個具體的還是要根據自己的學校來，可以在手機上面的迅捷論文查重上面查重一下，這樣的數據比較準確。

何必有論文查重時，包括參考文獻相似，比你這個問題說的很籠統，應該具體一點，說清楚之后我才能給你解答

1.可以肯定的給大家回答，正規畢業論文查重是不包括參考文獻的，參考文獻并不在畢業論文查重范疇內。可是畢業論文查重并不能夠識別全部的參考文獻，只有符合格式的參考文獻才會被畢業論文查重識別出來，這也就意味著只有參考文獻的格式規范且正確的時候，畢業論文查重才會將該部分參考文獻排除出查重范疇。所以畢業論文查重不包括格式正確的參考文獻。

2.為什么畢業論文查重報告中有時候會將參考文獻部分標紅呢?有以下兩個原因，可能論文作者選用了不正規的查重軟件對論文查重，而這些不正規的查重軟件不是正規的畢業論文查重，因此無法識別參考文獻，從而導致參考文獻飄紅;二是論文的參考文獻格式不正確，導致畢業論文查重軟件無法正確識別該部分的參考文獻，進而將該參考文獻部分標紅，如果該部分參考文獻格式正確就會被畢業論文查重識別，進而不會納入查重范疇以內。

查重論文請使用正規靠譜的查重系統，比如學術、維普、萬方、PaperPP。